건국대 연구팀, ‘산업 대장균’ 유전체 정보 규명
산업 대장균 BL21은 바이오화학 제품과 바이오 연료를 생산하는 데 활용되는 균주다. 효소, 항체 등의 재조합 단백질과 함께 바이오화학제품과 바이오연료를 생산하는 미니 생체공장이라 불리고 있다. 대장균을 포함한 산업 미생물은 석유화학을 대체하는 친환경 바이오 제품의 생산에 기여할 수 있다.
지금까지는 산업 대장균의 유전자 기능 및 발현에 대한 정보가 부족하여 유전체 조작을 통한 생산공정 개발에 어려움이 있었다. 이에 따라 산업 대장균 내 모든 유전자의 종류와 기능을 밝히고 그 중 실제로 발현되는 유전자들의 시작 및 종결위치를 찾아내는 작업이 필요했다.
건국대 윤성호 교수 연구팀은 산업 대장균 BL21(DE3)의 유전체와 전사체등 유전정보를 통합 분석하여 기존 유전자 정보를 업데이트하고 신규 유전자 37개와 비번역(non-coding) RNA*(단백질로 번역되지 않고 유전자들의 발현을 조절하는 RNA) 66개를 발견했다.
이를 토대로 함으로써 유전체 내 실제로 RNA로 발현되는 전사체 지도(유전자 발현 지도)인 전사체맵*(transcriptome map)을 완성하였다.
연구팀이 산업 대장균의 생체 정보를 확보함으로써 유전체 조작을 통한 바이오제품의 생산 균주 개발에 기여할 것으로 기대된다.
*유전체와 전사체 : 유전체는 한 생물체의 유전 정보 전체를 말하며 전사체는 한 세포 안에서 발현되는 RNA 전체를 뜻함. 유전체와 전사체의 통합분석은 서열해석, 유전자분석 및 네트워크 구조 등의 연구를 말함.
*비번역(non-coding) RNA : 단백질로 번역되지 않고 여러 유전자들의 발현을 조절하는 RNA
*전사체맵 : 유전체 내 실제로 RNA로 발현되는 부분에 대한 위치 및 발현강도 정보
유전체와 전사체의 통합분석이란 유전체 염기서열 분석을 통해 유전자 종류 및 위치를 예측하고 여러 실험조건에서 실제 RNA로 만들어지는 유전자 정보를 더해 유전체 주석화*를 보다 정확히 하는 방법이다.
*유전체 주석화 (genome annotation) : 유전체 내 포함된 유전자 기능과 위치를 결정함. 이는 해당 유기체의 과학적, 산업적 연구에 가장 기본적으로 이용되는 정보
이번 연구에서 사용한 다중 오믹스* 통합분석 기술은 다른 미생물의 유전체 분석에도 적용 가능하다.
*오믹스(omics) : 세포 또는 개체 내에서 발현되는 모든 유전자, RNA, 단백질, 대사물질 등 생명현상과 관련된 중요한 물질에 대해 개별적이 아닌 통합적으로 분석하여 생명현상을 연구하는 학문
건국대 윤성호 교수는 “이 연구성과는 바이오산업에 유용한 산업 대장균의 생체 정보를 확보한 것”이라며 “앞으로 유전체 조작을 통한 다양한 바이오제품의 생산균주 개발에 필수적인 정보와 기술에 기여할 것으로 기대된다”고 밝혔다.
이번 연구 성과는 미래창조과학부·한국연구재단의 기후변화대응기술개발사업과 농림축산식품부·농림수산식품기술기획평가원의 포스트게놈다부처유전체사업의 지원을 받아 수행됐으며 생명과학 분야 국제학술지인 ‘뉴클레익 액시드 리서치’(Nucleic Acids Research)에 3월 31일자로 게재되었다.
웹사이트: http://www.konkuk.ac.kr
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